Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms