Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rnf40Q3U319 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rnf40Q3U319 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rnf40Q3U319 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rnf40Q3U319 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rnf40Q3U319 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rnf40Q3U319 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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