Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ankrd33bQ3U0L2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms