Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms