Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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