Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Rpusd3Q14AI6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Rpusd3Q14AI6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Rpusd3Q14AI6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpusd3Q14AI6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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