Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms