Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms