Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrriq1Q0P5X1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms