Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms