Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms