Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms