Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RykQ01887 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RykQ01887 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RykQ01887 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RykQ01887 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RykQ01887 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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