Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms