Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms