Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pkp1P97350 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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