Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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SbdsP70122 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SbdsP70122 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SbdsP70122 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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