Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Acta1P68134 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Acta1P68134 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Acta1P68134 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms