Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GferP56213 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GferP56213 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
GferP56213 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
GferP56213 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
GferP56213 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
GferP56213 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
GferP56213 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GferP56213 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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