Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dbx1P52950 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms