Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SftpbP50405 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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SftpbP50405 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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