Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms