Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gli1P47806 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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