Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ItgavP43406 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms