Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms