Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtlP38585 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtlP38585 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtlP38585 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms