Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprkP35822 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms