Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms