Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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