Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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