Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms