Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P20040 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P20040 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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