Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Defa-rs1P17533 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Defa-rs1P17533 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Defa-rs1P17533 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Defa-rs1P17533 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa-rs1P17533 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa-rs1P17533 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa-rs1P17533 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa-rs1P17533 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa-rs1P17533 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa-rs1P17533 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa-rs1P17533 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa-rs1P17533 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa-rs1P17533 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa-rs1P17533 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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