Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou4f1P17208 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms