Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Tnp1P10856 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms