Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lnx1O70263 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms