Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm2888K7N746 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm2888K7N746 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm2888K7N746 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm2888K7N746 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm2888K7N746 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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