Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm3336J3QMQ6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm3336J3QMQ6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm3336J3QMQ6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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