Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20830J3KML6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms