Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r58G3X9U3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms