Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms