Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms