Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms