Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fndc1E9Q043 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc1E9Q043 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms