Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms