Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan18E9PUD6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan18E9PUD6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan18E9PUD6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan18E9PUD6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan18E9PUD6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan18E9PUD6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan18E9PUD6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan18E9PUD6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zscan18E9PUD6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms