Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh8D3Z6W3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms