Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm5478D3Z6R0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm5478D3Z6R0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm5478D3Z6R0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm5478D3Z6R0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5478D3Z6R0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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