Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clrn2B2RVW2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clrn2B2RVW2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Clrn2B2RVW2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn2B2RVW2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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