Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms